自動控制（control)系統(tǒng)應設計為中央監(jiān)控計算機控制型系統(tǒng)，同時計算機應設置在控制室。凈化實驗室必須控制實驗室的潔凈度，對新風進行過濾，使實驗室達到一定的凈化要求。其中排風系統(tǒng)是重點，對于保證實驗室相對負壓環(huán)境和有效過濾室內污染排風起著重要的作用。
實施計算機自動控制的計算機應該實時監(jiān)視機組和自動控制設備的運行情況，并具有歷史數據記錄、報警提示等功能。
室內氣流組織有效合理：有效就是避免所有房間內的死角，合理就是保證由清潔區(qū)流向
污染區(qū)的原則 (無論是清潔區(qū)還是污染區(qū)、半污染區(qū) 。
實施自動控制（control)的現(xiàn)場控制器應該選用高可靠、高速度、免維護的工業(yè)級控制器，而且控制器應該能脫離計算機而獨立工作，避免一旦計算機出現(xiàn)故障造成控制系統(tǒng)的癱瘓。實驗室凈化空氣調節(jié)系統(tǒng)必須可靠運行，采用先進技術，合理利用和節(jié)約能源與資源，保證環(huán)境的質量和安全，為實驗人員提供所需要的溫度和濕度，保障生物實驗在安全的條件下進行，以確保實驗結果得準確性。
凈化空調通風系統(tǒng)劃分有序：凈化空調通風系統(tǒng)歸納(指歸攏并使有條理)起來不外乎就如下三種劃分方式，可以根據需要進行適當的劃分：
控制系統(tǒng)上應該具有手動 自動轉換功能，保證在控制系統(tǒng)失控時人為轉換為手動控制。
節(jié)能運行
整個生物安全實驗（experiment)室送風一個系統(tǒng)、生物安全柜和其它房間 包括主實驗室 排風一個系統(tǒng)。
整個生物安全實驗（experiment)室送風一個系統(tǒng)，生物安全柜的排風一個系統(tǒng)，房間排風一個系統(tǒng)（包括主實驗室）。
實驗（experiment)室為直流式系統(tǒng)，能源的節(jié)約非常重要，常規(guī)的送排風的變頻節(jié)能控制（control)可以滿足這
種要求。
多個主實驗（experiment)室或只有一個主實驗室但準備間單獨使用時，各主實驗室獨立設置送排風系統(tǒng)，半污染區(qū)和清潔區(qū)另設獨立的送排風系統(tǒng)。
如果主實驗（experiment)室內存在不同數量的生物安全柜，則必須設置合理的變頻（frequency conversion)節(jié)能控制（control)方案，不僅滿足實驗室壓力梯度的要求，同時也可以兼顧節(jié)能。
排風系統(tǒng)考慮全面：正確確定主實驗（experiment)室的排風量(定義:單位時間內空氣的流通量)；排風口的設計必須合理有效（室內排風口與屋面排風口）；排風機(Draught Fan)互為備用、風量穩(wěn)定（解釋:穩(wěn)固安定；沒有變動)且送風
聯(lián)鎖：排風 . 級 $%"& 過濾，系統(tǒng)利于熏蒸消毒；負壓控制（control)，排風先導控制實現(xiàn)等。
自動控制（control)配合到位：主要是指靜壓差穩(wěn)定（解釋:穩(wěn)固安定；沒有變動)性能以及相關的響應時間以及控制精度（精確度）等問題。
