實驗室廢水的成分比較復雜，它受多種因素影響，如試驗過程所用的原料、化學藥劑、用水水質、水量、放射性同位素種類及使用后的化學組成等。一般廢水可分為三類：含有機物質的廢水、含無機物質的廢水、含有機物質和無機物質的廢水。

1.廢水。一般有物理法、化學法、生物法等。物理法主要利用物理作用以分離廢水中的懸浮物。化學法主要利用化學反應的作用來處理廢水中的溶解物或膠體物質。生物法是利用微生物的作用去除廢水中的交替和溶解的有機物質。
2.酸堿廢水處理實驗室排出一些酸性或堿性廢水，由于實驗室的性質和類型不同，所排出的酸性廢水種類、濃度等都不相同。因此，酸性廢水在需要處理時應和其他非酸性廢水分流排出。酸性或堿性廢水在可能和合理的情況下要盡量回收利用。
活毒廢水處理設備宜設在最低處，便于污水收集和檢修。
三級和四級生物安全實驗室防護區(qū)活毒廢水的處理裝置應采用高溫滅菌方式。應在適當位置預留采樣口和采樣操作空間。

四級生物安全實驗室雙扉高壓滅菌器的排水應接人防護區(qū)廢水排放系統(tǒng)。

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