化學實驗室的通風方式有兩種，即局部排風和全室通風。
局部排風是在有害物質產生后立即就近排出，這種方式能以較少的風量排走大量的有害物質，能量省而效果好，是改善現有實驗室條件可行和經濟的方法，也可能是適應新實驗室通風建設的最好方式。實驗室凈化工程國家實驗室代表國家最高水平，是按國際一流標準建立的，規(guī)模非常大，基本包括本學科領域所有研究方向，而且人員配備上要求面向國內外招聘最優(yōu)秀的研究人員，直接參與國際競爭，往往是多學科交叉的創(chuàng)新平臺。對于有些實驗不能采用局部排風，或局部排風滿足不了排風要求時，采用全室通風。
通風柜是實驗室中最常用的一種局部（part)排風設備，他的性能好壞主要取決于通過通風柜空氣移動的速度。影響正面速度和空氣運動的因素是渦流、柜的入口形狀、熱載量、機械作用、排風孔設計和阻凝物等。此外，尚于他的防火能力、耐腐蝕性、是否便于清洗以及污染物進入排風系統(tǒng)前收集某些污染物的能力等性能有關。一般認為，實驗室中的通風柜應能適應易燃的液體和氣體，而且結構材料應具有幾分鐘的耐火能力，以保持通風柜的完整和及時將火封熄。
通風柜的排風系統(tǒng)可分為集中式和分散式兩種。實驗室設備實驗脊椎動物生物安全防護實驗室，其適用微生物范圍與同級的一般生物安全防護實驗室相同。
※【集中式】是把一層樓面或幾層樓面的的通風柜組成一個系統(tǒng)，或者整個實驗樓分成一二個系統(tǒng)。實驗室凈化工程結構和設施、安全操作規(guī)程、安全設備適用于對健康成年人已知無致病作用的微生物，如用于教學的普通微生物實驗室等。它的特性是通風機少，設備投資省，而且對通風柜的數量稍有增減，以及位置的變更，都具有一定的適應性。然而由于系統(tǒng)較大，風量不易平衡，盡管每個通風柜上都裝有調節(jié)閥，但使用不方便，并且也不容易達到預定的效果。如果系統(tǒng)風管損壞需要檢修時，那么整個系統(tǒng)的通風柜就無法使用。所以，原來采用集中式系統(tǒng)的實驗室，先后都改為用分散式系統(tǒng)。
※【分散式】是把一個通風柜或同房間的幾個通風柜組成一個排風系統(tǒng)。他的特點是：可根據通風柜的工作需要來啟閉通風機，相互不受干擾，容易達到預定的效果，而且比集中式節(jié)省能源，因為集中式系統(tǒng)，只要一個通風柜在使用，就得開動大通風機。分散式由于系統(tǒng)小，排風量也小，阻力也小，所以通風機的風量、風壓都不大，躁聲與振動相應也較小。分散式還有一個特點，是對排出不同性質的有害氣體易于處理。缺點是通風機的數量多、系統(tǒng)多，如果通風機集中于通風機房內，那么投資就會增大，如果通風機分散布置，而且就地安裝，雖然通風機的投資增加，但風管的投資可節(jié)省，最后總投資不一定增大，建議使用分散式。
在劃分系統(tǒng)(system)時，同一個房間內如有兩個以上的通風柜，應劃為一個系統(tǒng)，避免一個通風柜在使用，其他的通風柜產生倒流，使室內受到污染。同樣，一個房間內除了一個排風系統(tǒng)外，不宜再裝置其他排風設備。
排風系統(tǒng)的通風機，一般都裝在屋頂上，或頂層的通風機房內，這樣可不占用使用面積，而且使室內的排風管道處于負壓狀態(tài)，以免有害物質由于管道的腐化侵蝕 或損壞，以及由于管道不嚴密而滲入室內，此外，通風機安裝在屋頂上或頂層的通風機房內，檢修方便，易于消聲或減振。
排風系統(tǒng)有害物質排放高度應按現行的《工業(yè)企業(yè)設計衛(wèi)生標準》和《工業(yè)三廢排放標準》執(zhí)行。在一般情況下，如果附近五十米以內沒有較高建筑物時，排放高度應超過建筑物最高處兩米以上。
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